MI Sirajul Huda mengembangkan Program Unggulan Hafalan Kitab Dasar, Khomsun Mutun, dan Mahfuzat sebagai fondasi pendidikan keislaman sejak dini. Peserta didik dibimbing untuk membaca, menghafal, dan memahami matan secara bertahap sesuai jenjang kelas.
Materi yang diajarkan meliputi Aqidatul Awam dalam bidang tauhid, Safinatun Najah dan Mabadi Fiqhiyyah dalam fikih, serta Al-Ajurumiyyah sebagai dasar ilmu nahwu dan tata bahasa Arab.
Dalam bidang tajwid dan adab, peserta didik mempelajari Hidayatus Shibyan, Tuhfatul Athfal, Alala, serta bagian-bagian pilihan dari Ta’limul Muta’allim. Program ini juga dilengkapi hafalan doa harian, hadis pilihan, dan Mahfuzat berisi ungkapan hikmah berbahasa Arab.
Melalui program ini, peserta didik diharapkan memiliki dasar ilmu agama yang kuat, kemampuan membaca kitab, daya ingat yang baik, kedisiplinan, kecintaan terhadap bahasa Arab, serta akhlak mulia yang tumbuh dari tradisi pendidikan pesantren.
